你有没有发现自己被质粒页面上各种各样的信息搞糊涂了?好吧,为了最大限度地利用这些页面,我们写了这篇文章来指导你浏览它们,并充分利用你的同事提供的所有信息。
质粒页面的顶部
任何质粒页面顶部的“面包屑”轨迹给出了嵌套质粒页面的网页层次。你可以在上面的例子中看到,面包屑轨迹开始于浏览页面,继续通过存放实验室页面,然后上出版物页,最后到个人质粒的页面. 存放实验室页面包含来自同一实验室的所有质粒,而发布页面包含来自同一出版物的所有质粒。
接下来是质粒的名字这是沉淀实验室为构建体提供的名称。集合中可能有其他具有类似名称的质粒,但您可以使用此名称从我们的搜索页面(查看这个视频你可以搜索我们的网站)。通过搜索找到这个质粒的一个更快的方法是…
Addgene质粒数:这是在我们的目录中给每个质粒的唯一编号-如果你知道你要搜索的质粒的目录编号,这是最快和最简单的方法找到它!
- 那些火焰是怎么回事?
火焰标志:在一些Addgene的质粒旁边出现的火焰表明它很受欢迎。黄色火焰表示质粒已被订购20次以上;红色,50多个;和蓝色,超过100倍!当你搜索对于我们网站上的质粒,可用的过滤器之一(例如,仅显示订购超过100次的质粒)。
- 我想受欢迎是件很酷的事,但是我怎么知道一个质粒对我是否真的有用呢?
质粒的目的:这是对质粒在沉淀实验室中的设计和用途的简要描述,尽管您可能有完全不同的用途!我们质粒页面的这一部分相对较新,因此我们的一些旧质粒可能没有该字段的条目。如果您无目的地沉淀质粒,并且希望填充在本节中,让我们知道!
- 有没有一种方法能让我快速检查出质粒的结构特征,看看我是否能轻易地把我的基因克隆进去?
你最好的选择是质粒图谱:我们根据存款人提供的质粒序列和特征信息,自动生成质粒地图。许多存款人也上传他们自己详细的质粒图作为沉积过程这些图也可以在这个位置找到。这些图使科学家很容易看到质粒是否对他们自己的研究有用,并帮助请求者在他们自己的实验室中使用质粒。我们强烈鼓励寄存者尽可能提供质粒图.GenBank文件也可以上传到我们的质粒页面上,但这些都可以在质粒页面的“资源信息”部分找到(下面讨论)。
- 伟大的现在,如果我想在出版物中使用这个质粒,我怎么知道该确认谁?
存放实验室:该构造在其实验室中制造的首席研究员(PI)的名字。存款人名称链接到一个页面,列出通过Addgene可获得的所有PI质粒。
出版:如果质粒已经发表,第一次使用它的论文将列在质粒页面。的文章链接链接到一个页面,列出了这篇论文中所有通过Addgene获得的质粒。在页面底部可以找到更多的资源,帮助你在自己的作品中引用该出版物:
如何引用这个质粒:收件人:科学家确认书(RSA)要求科学家在出版物中使用他们的质粒时引用沉淀实验室。Addgene提供了一个模板引用,供您在引用同事的质粒时在材料、方法和参考资料部分使用。使用Addgene目录号可以轻松找到您在研究中使用的Addgene质粒的模板引用!
序列信息存款人可以提供其质粒的全部或部分序列信息,如果是这样,这些信息将作为“存款人序列”提供。额外的部分序列信息也可以从Addgene的测序反应中获得(“Addgene Sequences”)。这些序列以FASTA格式提供(例子),并可使用Addgene’s进行分析分析序列工具.
- 太好了,我如何检查质粒是否在我实验室的预算之内?
订购:检查价格当然!有些商品的价格是不同的,例如,质粒包比单独购买试剂盒中的每个质粒的成本更低。
- 如果我订购了质粒,他们会怎么寄给我?
描述:描述质粒或其他产物(工具包,共用图书馆等)将发送给您。Addgene的大多数单质粒在室温下作为细菌刺针发送。
质粒核心页-质粒核心
- 我看过地图,我知道质粒的用途,在哪里可以找到关于质粒内容物的详细信息?
我们的质粒页面的中间部分包含了在实验中使用质粒所需的所有详细信息:
骨干:最初的载体,沉积实验室修改以创建新的质粒。的Addgene载体数据库有关于公共向量主干的更多信息。列出的主干修改可以指存放实验室或以前的组对原始主干所做的更改。如果质粒是通过修改先前存放在Addgene中的载体制成的,您可以在此处列出原始载体的质粒编号。
基因/插入:它描述了被插入到主干中的内容,并提供了有关相关基因或DNA元素的信息。如果寄存者已经指出在基因/插入内发现了一个特殊的突变,这个信息可以在这里找到。可能有多个基因插入到主干中,每个基因在质粒页面上都有自己的基因/插入部分。标签被列出是根据他们将结束在N或C端转录和翻译插入。如果它是一个带有标记的空向量,则它的终止将被列为成功克隆后标记最有可能终止的终止。
克隆信息:本节提供有关载体组装的有用信息,并使要求实验室能够在自己的实验室中利用和修改质粒。如果存款人提供了引物序列供使用,则列出来。我们还提供链接到我们用于测序的常用引物列表。
细菌的增长:本节描述如何在携带质粒的菌株中生长。拷贝数(如果已知)抗生素耐药性,列出了最佳生长温度,以及菌株的名称。大多数Addgene质粒维持在大肠杆菌实验室菌株DH5a,但其他可能需要菌株,如ccdB生存(对于网关质粒)。我们还喜欢储存需要额外稳定性的质粒,例如我们的一些188完整比分直播,在NEB稳定的细胞中。
资源信息:本节包含有关质粒谱系的信息(例如,它是否来源于在不同实验室制造的质粒-或从Addgene获得的质粒!)。它还包含与质粒分发协议的链接。所有Addgene质粒都是根据UBMTA保护储户的知识产权,但也可能有额外的相关术语,例如当质粒含有某些荧光蛋白时。金宝搏app下载最后,对于许多质粒,您可以在这里找到由存款人提供的附加资源,包括genbank文件和协议。
引用此质粒的文章:这是我们的质粒页面的一个相对较新的功能,并提供了一个使用质粒的出版物列表(参见我们的博客)以获取有关此功能的更多信息!这意味着你可以看到哪些实验室已经使用了特定的质粒,以及在哪些实验系统中验证了它。
请记住,我们质粒页面上的所有信息都来自我们的存款人。您在存款过程中提供的信息越多,您的质粒页面对您的同事就越有用。如果您对我们的质粒页面有任何疑问,请随时联系我们help@addgene.org
参考资料在Addgene博客188博金宝官网
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- 了解我们是如何做的Addgene的质量控制
Addgene.org上的资源
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