为你的研究找到最好的质粒可能是一个艰巨的挑战。有超过80,000个来自世界各地的储存质粒，很难找到你最喜欢的基因、启动子、血清型或无数其他东西。这就是为什么我们已经建立了一个新的和改进的搜索引擎，以帮助使这项任务更快，更容易，没有挫折的体验。随着搜索的更新，我们也更新了我们的主页和吉祥物Blugene(查看12月5日来了解更多!)
我收集了一系列的屏幕截图，突出了搜索设计和功能的变化。
更好的搜索方式
首先，看看Addgene的新主页。你可能注意到了前面和中间的搜索区域。
让我们输入“crispr”，看看会出现什么。甚至在点击“搜索”按钮之前，一个新的内容感知的建议下拉列表将让你直接跳转到你在我们的目录或教育资源中寻找的信息类型:质粒、汇集图书馆、博客文章、协议，等等。选择crispr将返回链接包括我们的CRISPR指南．
为了更深入地了解这种新功能和导航方法，我们将搜索钙生物传感器，GCaMP，并点击到质粒搜索结果:
超过200种不同的含有GCaMP的质粒可供分配。
如果你的实验涉及使用AAV传输钙生物传感器，你可能会决定你真的更喜欢订购现成的病毒而不是在你的实验室里生产和提纯。现在，你可以使用搜索页面上的下拉菜单快速跳转到不同类型的项目，而不是开始一个新的搜索或点击到网站的不同部分:
你有没有注意到，当我们搜索的是病毒准备物而不是质粒时，“筛选通过”选项改变了?可用的过滤选项现在根据材料的类型和使用的特定搜索词动态改变，所以你将只显示与你当前搜索相关的过滤器。我们稍后会详细介绍过滤器。首先，我想强调一下我们的新搜索工具让你从期刊文章中获取质粒的便捷方式。
从纸到质粒
作者经常指出，他们的质粒可在方法和材料或其他地方的论文Addgene。也许他们开始了出版前保证金并且能够包含特定的质粒ID号。如果你知道一个质粒的ID号，直接搜索就更容易了，在下拉列表的底部直接链接到质粒页面:
搜索栏会提示直接链接到其他类型的搜索，包括存放实验室和机构。例如，搜索“Melina Fan”，你就可以直接进入一个页面，看到我们自己的CSO储存的质粒。
但是如果你没有质粒ID号，或者你不确定是否有来自论文的质粒被储存了呢?在这个例子中我们将寻找重组单克隆抗体质粒詹姆斯机实验室在eLife发表。
Addgene目前正在为神经科学研究分发94个表达有效抗体的质粒(见NeuroMab集合详情)。下面的屏幕截图显示了我们可以使用的不同术语的范围，以查找本出版物的资料。
搜索论文的标题是有效的
你也可以通过文章的PubMed ID (PMID)找到相关的质粒
．..或DOI
或者获得一些足够接近的关键词……
如果在过去你尝试过在Addgene质粒搜索中组合多个词，但发现结果令人困惑，我相信你会发现Addgene新推出的搜索引擎结果要好得多。在这里，我想从NeuroMab收集的质粒中找到一种针对PARIS的抗体，PARIS是一种参与帕金森病神经退化的锌指蛋白。了解质粒是在哪里创建的，可以将搜索结果缩小到你所需要的范围:
使用过滤器更好地搜索
并不是所有的质粒搜索都是从发表开始的。你可能有一个在实验中有用的质粒的想法，并想看看是否有人已经创造并储存了Addgene。将搜索词与过滤器结合起来可以让您深入到所需的确切质粒。
对Addgene的质粒搜索来说，能够应用广泛的过滤器并不是什么新鲜事。质粒搜索页面的新设计将过滤器从页面左侧的一长列移动到搜索栏下方的一系列智能下拉菜单。当你尝试不同的条件，你可能会发现可用的类别和过滤器改变，因为我们现在只显示与您当前的搜索条件和潜在结果相关的选项。正如在前面的布局中，匹配每个过滤器的质粒数量显示在括号中。
在这个例子中，我想找到一个在CMV启动子控制下表达泛素的慢病毒质粒。从两个搜索词开始，我们看到有很多结果，但我无法浏览300多个质粒。在“载体类型”下，我选择了“慢病毒”，它消除了大多数设计用于其他用途的质粒。
我可以通过这些36个质粒很可能找到一个有用的质粒，但是什么是流行的呢?梦寐以求的蓝色的火焰不仅仅是一个奖励的存款人和灵感的更新吉祥物，它也是一个方便的最要求的过滤器。如果使用第二个筛选，即来自“请求”类别的筛选，我们就只剩下一个质粒需要考虑了。
如果你走到这里，意识到你需要应用不同的过滤器，你不需要开始一个新的搜索。只需点击“X”旁边的任何过滤器来清除它。
这里有一个可用的过滤器列表，以优化您的搜索结果，以满足您的实验需求。记住，只有带有结果的过滤器才会显示出来!
质粒过滤器类
- 表达式:为您的研究选择模型系统(如。哺乳动物)
- 矢量类型:你计划做什么类型的实验?（如。逆转录病毒)
- 物种:指定基因插入的来源生物。（如。年代．酵母）
- 质粒类型:如果你想克隆你自己的插入物，选择一个空的主干，或者使用其他选项找到匹配你的搜索条件和基因的质粒，并引导RNA / shRNA插入
- 抗性标记:这表明在您的模型系统中使用的可选择的标记，与用于培养含细菌培养质粒的细菌抗性标记不同
- 细菌耐药:用它来选择用于细菌选择的抗生素耐药基因。
- 病毒服务吗?：Allows you to filter results to only show plasmids with现成的病毒制剂可用
- 服务:如果有可用的病毒，这个过滤器将允许通过血清型或慢病毒准备来改进
- 请求:只看到请求数量超过指示数量的质粒
- 对工业的可用性:限制对质粒的搜索可以分发给工业研究科学家吗
病毒准备过滤器类别
- 启动子:为你的目标细胞类型选择最佳启动子
- 血清型:选择所需的AAV衣壳或慢病毒准备
- 标签:识别特定的标记蛋白
- 用途:类似于“矢量类型”，您可以根据实验目的进行过滤(如。CRISPR)
除了搜索
如果你没有任何特定的搜索词，你该怎么办?由Addgene的科学家们制作的精选集页面可以让你浏览质粒的类别，这些类别可能很难通过简单的搜索来定义。
这些页面提供了有关主题的有用信息，链接到相关指南和协议，并提供了易于分类的手工挑选的质粒表。搜索“RNA编辑”质粒会返回1300多个结果，而对“CRISPR”质粒进行过滤会保留其中一半以上的结果。相反，我们可以先导航到CRISPR资源页面：
该页面链接到指南，我们的CRISPR电子书，质粒工具包，以及根据功能分类的策划页面(如。碱基编辑)和目标生物。点击到RNA编辑带我们到一个页面，有一个基本概述和图表，然后是一个方便的质粒表格，专门为此目的设计:
还难住了吗?问一个Addgenie
新推出的搜索工具对我们的网站是一个很大的改进，我们希望它能引导你准确地使用你所需要的每一次使用。如果它没有，你发现自己在“错误的”质粒中跋涉，或者根本没有结果，请让我们知道!联系我们的科学技术支持help@addgene.org让我们来帮忙。
周四回来看看我们的吉祥物和主页的重新设计。
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