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利用AID对降解的蛋白质进行N或C末端标记的新工具包
生长素诱导降解(AID)利用被称为生长素的植物激素，有条件地、可逆地降解融合为降解结构域的蛋白。在植物中，生长素与SCF-TIR1泛素连接酶复合物的TIR1结合，促进其与degron序列的相互作用，最终降解。虽然其他真核生物本身没有这种反应，但它们确实包含AID所需的特定泛素连接酶途径。通过用一种名为mAID的7kD degron标记蛋白质，并在非植物细胞中表达必需的植物蛋白TIR1，该蛋白与细胞的内源性泛素连接酶相互作用，Kanemaki实验室能够将AID翻译给酵母，以及哺乳动物和人类细胞系（西村等，2009，夏目漱石等人，2016）.
金卷实验室之前开发了基于CRISPR / Cas9方法用mAID标记HCT116细胞内源性蛋白。利用这种方法，实验室能够生成一些必需蛋白质的条件等位基因(Natsume et al.， 2016)。现在，金卷实验室创造了一种新的工具包的质粒的N端或C端标记(Yesbolatova等人，2019年使用CRISPR)。这个工具包可以很容易地标记你感兴趣的蛋白质，以创建有条件的人类细胞系。最后，Kanemaki实验室证明，TIR1抑制剂auxinole能够充分抑制标记蛋白的基础降解，这是AID技术的一个常见问题(Yesbolatova et al.， 2019)。
Yesbolatova等人，方法，2019。PubMedPMID: 31026591．
通过工程SpCas9扩大CRISPRCas9的靶向范围
CRISPR / Cas9是广泛使用的基因组编辑工具。然而，Cas9的内切酶活性可能受到特定PAM(原间隔邻近基序)的限制，以结合目标位点进行编辑。PAM序列可由2-6个碱基对组成，并遵循Cas9核酸酶靶向的DNA序列。
的酿脓链球菌Cas9 (SpCas9)需要NGG PAM来识别靶标。Osamu Nureki他的实验室在设计SpCas9 (SpCas9-NG)时，对PAM的第三个碱基有了轻松的偏好，所以现在它能识别NG而不是NGG。除了工程SpCas9，他们还将SpCas9-NG与激活诱导胞苷脱氨酶target - aid -NG融合，该酶介导了人类细胞中NG PAM附近的靶位点上的C - T转换。SpCas9-NG及其变体的多功能性增加了，可以用于设计以前很难设计的特定位置。
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《科学》，2018。PubMedPMID: 30166441。
美人鱼-海洋通道视紫红质，用于光遗传工具箱
阴离子传导通道视紫红质(ChR)是一种可以抑制神经元活性的离子通道。今年早些时候赫格曼实验室合作者报告他们发现了一种来自海洋微生物的7个crs新家族基于宏基因组数据。美人鱼(Metagenomically discovered Marine，阴离子导电和强烈脱敏的ChRs)与目前使用的ChRs的不同之处在于，当暴露在连续的强光下时，它们会导致快速和几乎完全脱敏。脱敏是由保守的半胱氨酸介导的。随着美人鱼的引入，神经元可以快速和高精度地关闭-一个有价值的光遗传学研究神经元活动时的特征。
研究人员通过分析不同公开的宏基因组数据确定了美人鱼，包括塔拉海洋工程数据集。这项研究展示了将公开可用的宏基因组数据集的分析与生物物理研究相结合的力量，以及挖掘数据集用于研究和创新的潜力。
Opperman J等人，自然通信，2019。PubMedPMID: 31346176．
使用LADL光回路
哺乳动物基因组DNA不仅仅是一个在细胞核中蜿蜒的二维线性分子——我们的染色质由数千个环组成。这些环不仅提供了将基因组DNA装入细胞核的三维结构，而且被认为在许多基因的转录调控中发挥了关键作用。一个数量的组已设计方法研究内源性环对远端启动子和增强子，或者试图设计循环来创造通常不会发生的基因组相互作用。到目前为止，为这些实验开发的合成环化因子，如与dCas9结合的转录因子，需要较长的时间尺度与不可诱导的组成型表达蛋白结合。
为了进一步开发用于合成环路的dCas9，本研究采用Phillips-Cremins实验室开发了light-activated-dynamic-looping(LADL)系统．该小组将dCas9融合到一个截断的CIB1蛋白拟南芥(CIBN)，他们称之为LADL锚。使用专门设计的grna，他们可以将这些LADL锚招募到基因组目标，如远端启动子和增强子。与之前的迭代相比，LADL的独特之处在于它添加了另一个CRY2Arabidoposis在蓝光照射下与CIBN异二聚的蛋白质(见图1*)。当小组瞄准增强器区域时Klf4和启动子区域Zfp462，它们之间的距离超过500kB，他们能够观察到环的形成和增加Zfp462蓝光诱导4小时内表达(比以前开发的系统快6倍)。LADL系统由于其较短的时间尺度以及诱导和可逆的特性，有望成为基因组循环动态特性的一个更好的模型。
Kim等人，Nat Methods, 2019年，PubMedPMID: 31235883．
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