质粒101:如何在3个简单步骤命名您的质粒

给质粒命名并没有统一的规则，但这里有一些很好的指导方针可以遵循，以确保人们能够快速、轻松地识别出质粒包含的内容和其他重要信息。

提示:一个小写的“p”通常用作质粒名称的第一个字母，简单地表示该对象是一个“质粒”。p代表质粒。

步骤1:骨干名称

在质粒名称中包含空主干名称。这一简单的信息通常可以传达许多重要的细节。一旦你知道质粒所基于的骨架，你通常可以得到：a）细菌抗生素耐药性，b）驱动插入的启动子，以及c）任何其他选择标记（用于其他细胞类型，例如真核细胞）。

pBACKBONE-XXXXX

提示:如需已出版和商业可用的空主干目录，请访问矢量数据库．

步骤2:插入名称

在质粒名称中包含关于插入的信息。这通常是3-6个字母代表的基因(或DNA序列)。

pBACKBONE-hGene

提示:通常，研究人员会在插入的缩写词的开头加上一个小写字母，以明确该物种是什么。例如:“h”代表人类(智人)，“m”代表鼠标(亩骶)，“r”代表老鼠(家鼠或鼠属形)等。

步骤3:添加标签

添加任何标签或融合是在您的插入。通常你会列出任何标签或融合蛋白在质粒中出现的顺序以及它们与插入物的相对位置。例如，如果在插入的n端有一个Flag标记，则应该首先列出它。

pBACKBONE-Flag-hGene

如果还有一个EGFP融合到您的插入的c端，您将在插入后列出它。

pBACKBONE-Flag-hGene-EGFP

其他的考虑

如果插入包含突变或修改，则应将其包含在质粒名称中。突变一般是指氨基酸的变化而不是核苷酸的变化。表示氨基酸突变的正确方法是列出野生型氨基酸的一个字母缩写，紧接着列出其相对于起始蛋氨酸(Met)的位置(数字)，然后再列出当前该位置的突变氨基酸的一个字母缩写。

相反，插入的未突变或野生类型(wt)版本通常在插入名称之前或之后直接用“wt”表示。

例子:如果295位的谷氨酰胺突变为丙氨酸，Q295A。

突变版本:pBACKBONE-Flag-hGene -EGFP (Q295A)

野生型版:pBACKBONE-Flag-hGene-EGFP或pBACKBONE-Flag-hGene -EGFP (wt)

这些简单的规则让任何科学家都能知道质粒里有什么，以及如何使用它，只需要读一下名字。想了解更多关于质粒的特性和你可以在实验室中使用的技巧，请查看更多的帖子在我们的质粒101系列．