走近中国:2015年广东核酸论坛

由乔安妮·卡门

我自己从来没有去过中国,我很高兴能够参加,当组织者广州核酸论坛2015年会邀请我参加并讲述Addgene帮助科学家分享质粒的经验,特别是那些CRISPR品种(参见下面我演讲的幻灯片)。很大程度上由德米特里·萨莫斯基组织来自中国的团队非常热情Ribobio,杰出的演讲者名单吸引了许多赞助商总部设在世界各地。有三位诺贝尔奖得主,一位美国国立卫生研究院主任和BGI-China难怪300多名渴望了解核酸科学最新发现的中国科学家参加了这次会议。我很高兴地看到,大多数与会者都是科学家,仍然坐在替补席上工作。这是一个很好的机会和这么多科学家交谈他们是Addgene的潜在请求者储户中国是Addgene质粒请求数量排名前10的国家之一。

对广州与科学城的思考

中国广州户外市场

会议地点位于广州郊区美丽的毛凤山森林公园西侧现代化、相对较新的“科学城”区域。作为国家科技园,享受国家高新技术开发区的优惠政策,众多科技企业和初创企业选择落户。我做了是时候去广州参观一些景点了。最吸引我的是露天市场,人们可以在那里购买中药成分。那里有几百个小摊,卖着无数种商品,只有一小部分我能认出来。光是蘑菇品种就有几十种。至少我能分辨出它们是蘑菇。有时候,我分不清袋子里装的是植物还是动物。我试着找出某些成分可以用来做什么(比如干海马有什么用?),但周围没有说英语的人。

开幕演讲-基因组学的发现和超越DNA

埃里克·格林和基因组医学之路埃里克格林,主任国家人类基因组研究所从第一次主题演讲开始。他谈到了人类基因组计划对它的影响th美国国家卫生研究院如何看待基因组学的未来,以及奥巴马总统的未来精密医学项目以及这一举措将如何促进人类健康。听到基因组计划已经对未诊断和罕见疾病产生了重大影响,这是令人鼓舞的;在人类基因组计划之前,61种疾病的基因座被确定。目前,已有4163种单基因等位基因被鉴定,占已知罕见疾病的50%以上。

这次会议的一个意想不到的主题是,我们对RNA还有多少不了解。有一次演讲让我们深刻认识到这一点托德·劳来自加州大学。Lowe博士谈到了他对500多个人类tRNA基因的研究,到目前为止,我们忽略了这些转录本的调控片段。我记得当小RNA只是我们从凝胶底部跑出来的东西这样它就不会破坏北方的印迹结果我们没有给tRNAs太多的思考。高通量转录组测序方法,包括由编码项目财团没有很好地观察tRNAs,因为它们包含“硬停止”突变。Lowe实验室使用的新技术使他们能够开始理解trna和trna衍生的rna的复杂调控。请继续关注该领域的重大发展。

诺贝尔奖得主和不断扩大的RNA重要性

第二个主题演讲由诺贝尔奖得主杰克·绍斯塔克(Jack Szostak)主持。绍斯塔克博士的实验室继续研究细胞生命的起源。他的实验室长期以来一直假设生命始于RNA和简单的细胞膜。他最近的工作表明,他们在建立一个在没有进化的酶机制(即没有蛋白质的RNA复制)情况下的RNA化学复制系统方面取得了相当显著的进展。化学是复杂的,这项工作需要一个跨学科的团队。

Addgene Depositor, Craig Mellow谈论基于RNA的监测会议的第二天由诺贝尔奖得主(和Addgene depositor)拉开帷幕克雷格·梅洛.接受他开创性的工作RNAi更进一步,他的实验室正在研究如何做到这一点Argonaute途径可能与防止自我基因沉默有关。梅洛博士提出了一个假设,即这些途径参与了基于RNA的重复基因家族监测,并提供了一种比DNA复制更不容易出错的遗传方式。他也提到小rna是多么“令人惊讶”,并假设“我们低估了生物。”他进一步告诫要区分“更高”和“更低”的生命形式,因为我们有着数百万年的共同祖先蠕虫在进化趋异。

尼古劳斯·拉杰斯基马克斯·德尔布鲁克分子医学中心在调控RNA领域有了另一个意想不到的发现。Rajewsky实验室正在研究环状rna(谁知道……我几乎没听说过这些)。这些单链共价封闭rna在哺乳动物中似乎是保守的,在神经元中表达,在神经元突触中尤其丰富。shRNA沉默一个环状RNA,他们已经确定导致细胞迁移缺陷。他们已经创建了circRNA网站以便科学家可以查看公共circRNA数据集,并下载在RNA-seq数据中发现circRNA所需的定制python脚本。据我所知,我们还不知道环状rna的作用以及它们是如何作用的。

当然,没有CRISPR的会议是不完整的

迈克尔燕鸥来自佐治亚大学的研究CRISPR /中科院系统,因为它与它在对病毒入侵的原核免疫中的自然作用有关。他的实验室正在研究狂怒假单胞菌,这是一种存在于海水沸点处的超热菌。特恩斯博士对原核生物基因组的CRISPR区域的重复和不同方面作了很好的介绍。然后他描述了狂怒疟原虫是如何拥有防御DNA和RNA病毒的系统的——2个cas系统在DNA水平上调控,1个在RNA水平上调控。

乌迪·基姆隆和他的耐抗生素病原体清单Udi Qimron来自特拉维夫大学的研究人员随后谈到了使用CRISPR/cas来解决日益严重的抗生素耐药性细菌的临床问题。请看左边的图片,他列出了“ESKAPE”抗生素治疗导致医院出现重大问题的细菌种类。Qimron博士建议使用带有CRISPR/cas9致敏基因盒的细菌噬菌体载体。这些载体被设计来取代细菌中的耐药基因,从而使细菌对已知的抗生素敏感。这些可以用在医院的表面和洗手液中。

有很多实验室使用CRISPR/cas9的聪明方法还有更多的报道。周Songyang来自贝勒医学院和中山大学的研究人员提出了两项新的技术发展。使用Tet-on系统,他的实验室创造了一个四环素cas9诱导敲除系统.他的实验室也在探索来自不同物种的Cas9蛋白基因组工程。

最后一个主题演讲是由诺贝尔奖得主做的托马斯·施泰茨耶鲁大学。他介绍了在他的实验室进行的核糖体结构研究的最新发现。RNA是核糖体复合体的结构和功能组成部分,斯泰茨博士打趣说,核糖体中的RNA具有复杂的构象,“不像DNA具有乏味的结构”。这无疑总结了本次会议——核酸科学在这一领域的研究人员仍然有许多惊喜。


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