在这个季度的博客系列中,我们将重点介绍Addgene的一些新的CRISPR质粒。我们仍然会定期更深入地关注特定的CRISPR质粒工具(例如最近的博客文章'编辑,IgnaviCas9,Nanoblades),但我们希望这个博客系列能帮助你找到更多新的CRISPR工具来进行研究!
这一次:
- CRISPRi在洋葱
- 基本编辑
- 用于表位标记的CRISPR工具包
- 基于慢病毒衣壳的Cas9/gRNA核糖核蛋白传递
- 胞嘧啶脱氨酶用于RNA编辑
CRISPRi的工具包洋葱
西尔维亚卡多纳·的实验室最近开发了一个CRISPRi的工具包洋葱这是一种能引起人类疾病的细菌。该系统的表达可通过鼠李糖诱导启动子进行调节。而这个系统是为洋葱在美国,他们确定了67个变形菌属,这个工具包可能会用于这些细菌。
- 读报ACS合成生物学
- 找到CRISPRi工具包
安全腺嘌呤碱编辑器
今年早些时候,基斯Joung的实验室发达安全胞嘧啶碱基编辑器,与大鼠APOBEC1相比,它降低了偏离目标的基因组编辑率。现在,他们利用降低rna识别能力的蛋白质截断策略,设计了安全腺嘌呤碱基编辑器变体。
诱导c -t和a - g突变的单碱基编辑器
Nozomu Yachie的实验室最近开发了一种碱基编辑器,将C-to-T和a -to- g碱基编辑器的功能结合到一个蛋白质中。他们将激活诱导的胞苷脱氨酶(AID)和工程tRNA腺苷脱氨酶(TadA)融合到催化受损的细胞上酿脓链球菌Cas9。他们称这种编辑器为Target-ACE(腺嘌呤和胞嘧啶编辑器)。与哺乳动物细胞中两种碱基编辑酶的混合物相比,target - ace显示出更高的靶位点编辑效率。
- 读报bioRxiv
- 找到Target-ACE
基于CRISPR/ cas9的神经元表位标记工具包
哈罗德MacGillavry的实验室开发了一个基于crispr的工具包,用于神经元荧光标记的靶向基因组整合。他们的工具包名为ORANGE(神经元基因组编辑应用开放资源),介导了神经元荧光标记的基因组整合。
以慢病毒衣壳为基础的生物纳米粒子递送Cas9/gRNA核糖核蛋白
CRISPR/Cas9在细胞中的瞬时表达具有降低脱靶活性和降低对Cas9的免疫应答等优点。最近,陆次白松露的实验室开发了一种基于慢病毒衣壳的生物纳米颗粒系统,用于包装Cas9/gRNA核糖核蛋白以实现瞬时表达。他们用一个com适体结合适体结合蛋白包装成慢病毒样粒子。
胞嘧啶脱氨酶用于RNA编辑
冯张的实验室以前开发的可编程的腺苷肌苷(A-to-I) RNA编辑器称为REPAIR通过将催化失活的rna靶向Cas13 (dCas13)与ADAR2的腺嘌呤脱氨酶结构域融合。现在,他们通过将ADAR2的腺嘌呤脱氨酶结构域进化为胞苷脱氨酶,进一步发展了这种C-to-U编辑器。此编辑器仍保留A-to-I编辑。这个系统被称为RNA编辑特定的c - u交换(简称RESCUE)。
如果你有一个新的CRISPR工具,你最近存入了Addgene,并且你希望它被包含在下一篇CRISPR的新博文中,请告诉我们。我们也欢迎客座博主的博客文章。看看这篇博客为更多的信息。
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